Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd2E9Q5F9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd2E9Q5F9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd2E9Q5F9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms