Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms