Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NbasE9Q411 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NbasE9Q411 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms