Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C2cd2E9Q3C1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2cd2E9Q3C1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms