Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms