Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf11E9PZM7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms