Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd1E9PZ26 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms