Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf2E9PXF8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbf2E9PXF8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms