Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms