Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms