Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms