Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8994E9PV04 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms