Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syde2E9PUP1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms