Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc18b1D3Z5L6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc18b1D3Z5L6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms