Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms