Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SafbD3YXK2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms