Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17333C6EQI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms