Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppfia1B2RXQ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms