Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cspp1B2RX88 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms