Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rd3lB2RV38 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms