Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms