Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms