Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zscan5bB2RTN3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zscan5bB2RTN3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zscan5bB2RTN3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zscan5bB2RTN3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zscan5bB2RTN3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms