Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2012B1B0R1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2012B1B0R1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms