Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtprsB0V2N1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprsB0V2N1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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PtprsB0V2N1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprsB0V2N1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms