Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf2A3KGV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms