Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r232A2RTT5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms