Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Frmpd1A2AKB4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Frmpd1A2AKB4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms