Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34dA2AGU5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34dA2AGU5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms