Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms