Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2dnl2A2AFH2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms