Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8nlA2ABX0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms