Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700023F06RikA2AB62 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms