Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l1A2A259 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l1A2A259 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms