Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms