Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RNP2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms