Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm28490A0A087WRT9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm28490A0A087WRT9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm28490A0A087WRT9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28490A0A087WRT9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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