Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5U3

Ighv1-62-1, Immunoglobulin heavy variable 1-62-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms