Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top3bQ9Z321 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms