Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt27Q9Z320 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms