Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc23a1Q9Z2J0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc23a1Q9Z2J0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms