Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms