Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms