Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms