Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HnrnpcQ9Z204 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HnrnpcQ9Z204 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HnrnpcQ9Z204 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HnrnpcQ9Z204 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HnrnpcQ9Z204 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms