Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S3

Rasgrp1, RAS guanyl-releasing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp1Q9Z1S3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms