Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lgr5Q9Z1P4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms