Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms