Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shcbp1Q9Z179 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Shcbp1Q9Z179 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms