Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccl8Q9Z121 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccl8Q9Z121 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccl8Q9Z121 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccl8Q9Z121 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccl8Q9Z121 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccl8Q9Z121 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl8Q9Z121 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms